IDT NGS二代测序文库构建试剂盒
——文库制备、测序接头、标签引物、杂交捕获探针组Panel


北京泽平代理的美国进口IDT NGS二代测序（下一代测序）产品，包括DNA和RNA文库制备试剂盒、定制和通用测序接头（Adapter）、标签引物（含Index序列引物）、定制和即用型杂交捕获探针组（Panel，如即用型外显子杂交捕获Panel等）、扩增子测序探针组Panel、文库均一化试剂盒等，适用于Illumina测序仪，用于全基因组测序、外显子测序、宏基因组测序等，为生命科学研究者提供高通量测序一站式解决方案。


 

 

 
一、IDT xGen 文库制备试剂盒

xGen DNA、RNA文库制备试剂盒，采用酶法、超声打断（机械打断）片段构建文库，并提供福尔马林固定、石蜡包埋（FFPE）等低质量样品的文库构建方案。IDT xGen DNA 文库构建试剂盒，只需10pg~1μg样本，将片段切割（酶法）、末端补平、末端加dA、P5/P7接头连接（试剂盒不含接头）、磁珠纯化整合至一个单管反应中，序列覆盖高度均一。
 

 

 

 

 


 
二、IDT xGen 接头 & 标签引物

提供多种即用型和定制化长接头（完整接头）、通用型短接头（短Y接头）、标签引物等，以灵活构建文库。
 


①全长接头——定制化或通用完整接头Adapter，由P5/P7序列+样本标签（Index）+测序引物结合位点（Read 1/2 SP，即Rd1/Rd2 SP）+分子标签（UMI，barcode）组成，连接DNA后无需PCR，可直接上机测序。

每个Index样本标签由8或10个碱基组成，用于区分不同文库，兼容2色和4色Illumina测序仪，支持定制单标签（Single Index）、序列特异双标签（Unique Dual Index, UDI）、组合型双标签（CDI），Illumina建议使用UDI序列特异双标签来减少标签串扰引起的错误。

UMI分子标签是短序列，可为文库中的每个DNA片段上加入一个唯一的标记，PCR扩增的序列具有相同的插入片段和UMI分子标签，用于识别原始样本中的等位基因突变是真实的低频突变还是文库PCR扩增或测序导致的错误，提高突变检测灵敏度。

②短接头——通用双链体接头Adapter，连接到DNA片段后，使用含Index样本标签的引物，通过PCR连接到短Y接头上。

③甲基化接头——定制化接头，提供全长甲基化接头、短甲基化接头，用于重亚硫酸盐测序（甲基化测序）。

 

 

 
 

 


三、IDT xGen 杂交捕获探针组Panel

提供多种定制化和即用型捕获探针组（Panel），由生物素标记的120个核苷酸的DNA探针组成，提供全外显子Panel、遗传性疾病Panel、多癌种基因Panel等，使用方便快捷，帮助研究者针对特定基因组学应用快速开展工作，并支持研究者根据自身需求定制Panel。

1、xGen研究用外显子探针组V2

即用型xGen研究用外显子探针组（xGen Exome Hyb Panel v2）由 415,115条经过单独合成和质控的探针组成，覆盖34Mb靶序列区和39Mb端到端空间，是目前市售的较紧凑且覆盖度高的外显子靶序列富集探针组。这些高品质探针结合优化的杂交试剂和实验方案，可全面、均一地覆盖hg19或hg38基因组版本中的人外显子编码区。


2、xGen急性髓系白血病癌症基因检测探针组

即用型xGen急性髓系白血病癌症基因检测探针组（xGen AML Cancer Hyb Panel）可对与急髓自相关的＞260种基因进行靶序列富集，以迅速、重点识别疾病相关变体。捕获靶序列是通过对200名急髓自患者进行基因组和外显子测序来确定的，籍此提供了高度相关的探针组。

 
3、xGen多癌种基因检测探针组

即用型xGen多癌种基因检测探针组（xGen Pan-Cancer Hyb Panel）可捕获与12种肿瘤组织相关的127种常见突变基因。其设计依据是癌症基因组图谱（TCGA）网络对这12种癌症的＞3000种肿瘤进行的系统分析结果。

 
4、xGen遗传性疾病基因检测探针组

即用型xGen遗传性疾病基因检测探针组（xGen Inherited Disease Hyb Panel）专门针对21种遗传性疾病的基因和单核苷酸多态性（SNP）位点进行靶序列富集，如HGMD(r)数据库中定义的自闭症谱系障碍、心肌病和神经肌肉类疾病。

 
5、xGen研究用个人识别探针组

即用型xGen研究用个人识别探针组（xGen Human ID Hyb Panel）可以从较大的群体样本中识别出个人样本。此探针组包含229条探针，对76个基因组区的不同SNP位点进行靶序列富集，包括最小等位基因频率较高的SNP和性别标记物SNP，识别能力达到500万样本中＞1。建议作为嵌入探针组，用于在纵向研究中对样本进行溯源和管理。
 

6、xGen研究用人mtDNA探针组

即用型xGen研究用人mtDNA探针组（xGen Human mtDNA Hyb Panel）使用138条xGen Custom Hyb Panels-Production探针，完全覆盖16kb人线粒体基因组。建议将其作为更大型的捕获探针组的嵌入探针组，不会影响原有探针组的靶特异性和覆盖均一度。

 
7、xGen研究用新冠病毒探针组

即用型xGen研究用新冠病毒探针组（xGen SARS-CoV-2  Hyb Panel）跨越整个新型冠状病毒基因组，不易受来自不同毒株的已知和未知突变影响。

 
8、xGen拷贝数变异骨架杂交探针组

即用型xGen拷贝数变异骨架杂交探针组（xGen CNV Backbone Hyb Panel）由9,000多个单独合成且带有5'端生物素修饰的寡核苷酸探针组成，可以识别基因组拷贝数变异（CNV）中易位、倒转、缺失和/或重复的准确位置，在整个人参考基因组中，大约每0.34Mb便会有一个探针覆盖，用于癌症、自身免疫性疾病或遗传性疾病的根本原因研究。


9、xGen定制杂交捕获探针组

xGen定制杂交捕获探针组（xGen Custom Hyb Panel），包含高保真、单独合成的5′端带生物素标记的寡核苷酸，不同探针通过等摩尔浓度混合，保证了每个探针拥有同等代表性。随附IDT NGS功能性检测报告，以证明探针组功能。xGen定制杂交探针组已经过优化，可与xGen杂交和洗涤试剂盒、xGen通用封闭剂和xGen文库扩增混合引物联合使用。


10、xGen定制杂交捕获探针组-加速版

xGen定制杂交捕获探针组-加速版（xGen Custom Hyb Panel—Accel），可提供快速交付服务，交付时间短，但不提供IDT NGS功能性检测报告。
 

11、xGen定制杂交捕获探针库

xGen定制杂交捕获探针库（xGen Custom Hyb Panels - Production），单独合成的5'端带生物素标记DNA探针，以补救现有即用型Panel捕获不良的区域（如第一外显子区和GC富集区），或用于靶向其他关注区域（如UTR非翻译区、内含子等）。
 


xGen封闭寡核苷酸与平台特异性接头结合，防止文库片段之间交叉反应，提高富集性能。xGen杂交捕获探针组在液相杂交捕获期间与所关注的靶序列区结合。然后使用链霉亲和素磁珠将靶序列区从溶液中分离出来。
 

四、IDT xGen扩增子测序Panel

扩增子测序通过PCR扩增进行目标序列的富集，与杂交捕获相比，工作流程简单，周转时间短，所需DNA样本量低，只需10~100ng。支持在单个反应中对100个~1000个扩增子进行多通路检测，实现高覆盖度。由于扩增子引物设计的精确性，相比杂交捕获具有更高的靶向率。适用于广泛的实验设计，如等位基因变异鉴定、结构变异和断点鉴定、用于微生物组研究的标记基因测序等。
 

 

 

 

 


 
五、IDT xGen Normalase 试剂盒

IDT xGen Normalase 试剂盒采用一种新型酶促文库均一化技术，可在Illumina测序仪上机测序前，对DNA或RNA文库进行均一化处理，无需对单个文库进行浓度检测，即可得到优化的簇密度和更均衡的文库。xGen Normalase方法可融入常规建库流程中，缩短实验整体时间，提高NGS文库上机浓度的精确性，生成更平衡均一的混合文库，允许更多样本混合上机，降低测序成本。Normalase不需要增加额外PCR步骤，仅需将常规文库扩增引物替换成带有Normalase标记的测序通用引物或带有Index的引物，实现快速、可拓展的文库标准化工作流程。

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