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IDT NGS二代测序文库构建接头
——UDI-UMI全长接头、通用短Y型接头、接头引物


 
北京泽平代理的美国进口IDT NGS二代测序DNA文库构建接头Adapter,提供即用型测序P5/P7全长接头(UDI-UMI接头)、通用短接头(短Y型接头)、测序接头引物(Index引物),以及定制合成长、短接头和接头引物服务,用于灵活满足Illumina二代测序基因文库建库需求。

IDT NGS二代测序文库构建接头 代理商北京泽平

 

应用 建议接头 特点
无PCR全基因组测序(WGS) IDT xGen UDl-UMI全长接头 无PCR的应用领域需要全长接头
无PCR宏基因组学
无PCR测序(初始量≥100ng)
低水平突变检测(低至约1%的频率) 灵敏度更高,使用UMI一致性分析去除测序错误
以全长、双链、初始cDNA开始RNA测序 更量化,去除PCR重复
甲基化测序 IDT xGen UDI-UMI 全长甲基化接头,xGen短接头加UDI引物对(甲基化接头) 亚硫酸盐转化需要甲基化胞嘧啶
全基因组测序(WGS) IDT xGen短接头加UDI引物对 流程简单,使用通用接头制备连接预混合液,并通过PCR引入样本标签
宏基因组(初始量为1-250ng)
外显子测序
生殖细胞系靶系列测序(SNP、插入缺失)


 


一、IDT xGen UDI-UMI全长接头
 
二代测序文库构建接头 IDT xGen UDI-UMI全长接头 代理商北京泽平

即用型IDT xGen UDI-UMI全长接头(完整Y型接头),DNA添加接头后无需进行PCR,可直接使用Illumina测序仪进行测序。IDT UDI-UMI全长接头序列由与Illumina Flowcell表面oligo互补的P5和P7序列、用于区分不同文库的序列特异双端标签(Unique Dual Index,UDI,即Barcode,含i5/i7 Index)、测序引物结合位点(Read 1 SP 和 Read 2 SP,即Rd1 SP 和Rd2 SP)、用于区分每一个DNA分子的唯一分子标签(Unique Molecular Identifier, UMI)组成。

IDT UDI-UMI接头整合了UDI接头和UMI接头优势,大大降低二代测序中的错配风险,更适合于灵敏检测需求。

IDT UDI序列特异双端标签(Unique Dual Index)在DNA片段两端各添加唯一Index,通过交叉验证Index,以区分不同文库,减少Illumina二代测序时的标签串扰和交叉污染问题,提高准确性。IDT Index标签序列由8或10个碱基组成,提供1536种Index,兼容2色和4色Illumina测序仪。

IDT UMI唯一分子标签(Unique Molecular Identifier)是短序列,在UDI基础上,为文库中的每个DNA片段上加入一个唯一的标记,使PCR扩增的序列具有相同的插入片段和UMI分子标签,用于识别原始样本中的等位基因突变是真实的低频突变还是文库PCR扩增或测序导致的错误,提高突变检测灵敏度。

 

 
二、IDT xGen 短接头和接头引物

二代测序文库构建接头 IDT xGen 短接头和接头引物 代理商北京泽平

即用型IDT xGen 通用短接头,为双链体接头(通用Y型接头,短Y接头),直接连接DNA片段后,需使用测序接头引物(Index引物),如UDI双端标签引物、或CDI组合型双标签引物,通过PCR将Index序列、P5/P7序列添加到短接头上。


 


三、IDT接头和接头引物定制合成服务

IDT提供定制合成服务,包括可兼容Illumina TruSeq平台、Nextera平台的各类全长接头、短Y接头、Index接头引物,支持定制单标签(Single Index)、序列特异双端标签(Unique Dual Index, UDI)、组合型双标签(Combinatorial Dual Index, CDI)、含UMI的双端标签(UDI-UMI)的接头或接头引物。

同时,IDT提供定制合成甲基化接头服务,包括UDI-UMI全长甲基化接头、短甲基化接头和UDI引物对等,用于亚硫酸盐测序(甲基化测序)。

二代测序文库构建接头 IDT接头和接头引物定制合成服务 代理商北京泽平

 

 
北京泽平代理的IDT二代测序文库接头和引物

 

货号 引物对数量 产品 特点
10006914 反应数 16 IDT xGen UDI-UMI全长接头  
10005903 反应数 96
10005976 16 IDT xGen 通用短接头和UDI引物 8nt
10005921 96 8nt
10005974   IDT xGen 通用短接头  
10005924
10005975 16 IDT xGen UDI引物 8nt
10005922 96 8nt 1号96孔板
10009816 96 8nt 2号96孔板
10008052 384 10nt 1-4号96孔板
10008053 768 10nt 1-8号96孔板
10008054 1536 10nt 1-16号96孔板
10008055 384 10nt 1-4号96孔板,2 nmol
10008056 768 10nt 1-8号96孔板,2 nmol
10008057 1536 10nt 1~16号96孔板,2 nmol
10009815 96 IDT xGen CDI引物 8nt
定制   兼容TruSeq平台的全长接头 可选配单标签(Single Index)、组合型双端标签(CDI)、序列特异双端标签(UDI)或含UMI分子标签的双端标签(UDI-UMI)。
定制   兼容TruSeq平台的短接头及标签引物  可选配单标签(Single Index)、组合型双端标签(CDI)或序列特异双端标签(UDI)。
定制   兼容TruSeq平台的标签引物  可选配单标签(Single Index)、组合型双端标签(CDI)或序列特异双端标签(UDI)。
定制   兼容Nextera平台的标签引物  可选配单标签(Single Index)、组合型双端标签(CDI)或序列特异双端标签(UDI)。
定制   甲基化接头和接头引物 甲基化全长接头、甲基化短接头和接头引物


 

 
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——IDT一级代理商,北京泽平

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