IDT NGS二代测序文库构建接头
——UDI-UMI全长接头、通用短Y型接头、接头引物
北京泽平代理的美国进口IDT NGS二代测序DNA文库构建接头Adapter,提供即用型测序P5/P7全长接头(UDI-UMI接头)、通用短接头(短Y型接头)、测序接头引物(Index引物),以及定制合成长、短接头和接头引物服务,用于灵活满足Illumina二代测序基因文库建库需求。
应用 |
建议接头 |
特点 |
无PCR全基因组测序(WGS) |
IDT xGen UDl-UMI全长接头 |
无PCR的应用领域需要全长接头 |
无PCR宏基因组学 |
无PCR测序(初始量≥100ng) |
低水平突变检测(低至约1%的频率) |
灵敏度更高,使用UMI一致性分析去除测序错误 |
以全长、双链、初始cDNA开始RNA测序 |
更量化,去除PCR重复 |
甲基化测序 |
IDT xGen UDI-UMI 全长甲基化接头,xGen短接头加UDI引物对(甲基化接头) |
亚硫酸盐转化需要甲基化胞嘧啶 |
全基因组测序(WGS) |
IDT xGen短接头加UDI引物对 |
流程简单,使用通用接头制备连接预混合液,并通过PCR引入样本标签 |
宏基因组(初始量为1-250ng) |
外显子测序 |
生殖细胞系靶系列测序(SNP、插入缺失) |
一、IDT xGen UDI-UMI全长接头
即用型IDT xGen UDI-UMI全长接头(完整Y型接头),DNA添加接头后无需进行PCR,可直接使用Illumina测序仪进行测序。IDT UDI-UMI全长接头序列由与Illumina Flowcell表面oligo互补的P5和P7序列、用于区分不同文库的序列特异双端标签(Unique Dual Index,UDI,即Barcode,含i5/i7 Index)、测序引物结合位点(Read 1 SP 和 Read 2 SP,即Rd1 SP 和Rd2 SP)、用于区分每一个DNA分子的唯一分子标签(Unique Molecular Identifier, UMI)组成。
IDT UDI-UMI接头整合了UDI接头和UMI接头优势,大大降低二代测序中的错配风险,更适合于灵敏检测需求。
IDT UDI序列特异双端标签(Unique Dual Index)在DNA片段两端各添加唯一Index,通过交叉验证Index,以区分不同文库,减少Illumina二代测序时的标签串扰和交叉污染问题,提高准确性。IDT Index标签序列由8或10个碱基组成,提供1536种Index,兼容2色和4色Illumina测序仪。
IDT UMI唯一分子标签(Unique Molecular Identifier)是短序列,在UDI基础上,为文库中的每个DNA片段上加入一个唯一的标记,使PCR扩增的序列具有相同的插入片段和UMI分子标签,用于识别原始样本中的等位基因突变是真实的低频突变还是文库PCR扩增或测序导致的错误,提高突变检测灵敏度。
二、IDT xGen 短接头和接头引物
即用型IDT xGen 通用短接头,为双链体接头(通用Y型接头,短Y接头),直接连接DNA片段后,需使用测序接头引物(Index引物),如UDI双端标签引物、或CDI组合型双标签引物,通过PCR将Index序列、P5/P7序列添加到短接头上。
三、IDT接头和接头引物定制合成服务
IDT提供定制合成服务,包括可兼容Illumina TruSeq平台、Nextera平台的各类全长接头、短Y接头、Index接头引物,支持定制单标签(Single Index)、序列特异双端标签(Unique Dual Index, UDI)、组合型双标签(Combinatorial Dual Index, CDI)、含UMI的双端标签(UDI-UMI)的接头或接头引物。
同时,IDT提供定制合成甲基化接头服务,包括UDI-UMI全长甲基化接头、短甲基化接头和UDI引物对等,用于亚硫酸盐测序(甲基化测序)。
北京泽平代理的IDT二代测序文库接头和引物
货号 |
引物对数量 |
产品 |
特点 |
10006914 |
反应数 16 |
IDT xGen UDI-UMI全长接头 |
|
10005903 |
反应数 96 |
10005976 |
16 |
IDT xGen 通用短接头和UDI引物 |
8nt |
10005921 |
96 |
8nt |
10005974 |
|
IDT xGen 通用短接头 |
|
10005924 |
10005975 |
16 |
IDT xGen UDI引物 |
8nt |
10005922 |
96 |
8nt 1号96孔板 |
10009816 |
96 |
8nt 2号96孔板 |
10008052 |
384 |
10nt 1-4号96孔板 |
10008053 |
768 |
10nt 1-8号96孔板 |
10008054 |
1536 |
10nt 1-16号96孔板 |
10008055 |
384 |
10nt 1-4号96孔板,2 nmol |
10008056 |
768 |
10nt 1-8号96孔板,2 nmol |
10008057 |
1536 |
10nt 1~16号96孔板,2 nmol |
10009815 |
96 |
IDT xGen CDI引物 |
8nt |
定制 |
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兼容TruSeq平台的全长接头 |
可选配单标签(Single Index)、组合型双端标签(CDI)、序列特异双端标签(UDI)或含UMI分子标签的双端标签(UDI-UMI)。 |
定制 |
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兼容TruSeq平台的短接头及标签引物 |
可选配单标签(Single Index)、组合型双端标签(CDI)或序列特异双端标签(UDI)。 |
定制 |
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兼容TruSeq平台的标签引物 |
可选配单标签(Single Index)、组合型双端标签(CDI)或序列特异双端标签(UDI)。 |
定制 |
|
兼容Nextera平台的标签引物 |
可选配单标签(Single Index)、组合型双端标签(CDI)或序列特异双端标签(UDI)。 |
定制 |
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甲基化接头和接头引物 |
甲基化全长接头、甲基化短接头和接头引物 |
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