IDT NGS二代测序DNA文库制备试剂盒
——基因组DNA文库构建、DNA甲基化文库构建
北京泽平代理的美国进口IDT NGS二代测序(下一代测序)DNA文库制备试剂盒,适用于Illumina测序平台,支持基因组双链DNA、cfDNA(循环游离DNA,circulating free DNA)、福尔马林固定或石蜡包埋(FFPE)组织提取的已降解DNA样本的文库构建,以及基于重亚硫酸盐转化的DNA甲基化文库构建。IDT NGS二代测序DNA文库构建试剂盒,所需起始样本量低,建库简单快捷,覆盖均一性好,适用于广泛、复杂的应用。
一、IDT xGen DNA Lib Prep EZ 文库制备试剂盒
用于双链DNA的NGS文库构建,样本兼容性好,文库产量高。采用酶切片段法建立文库,通过孵育时间控制DNA片段的切割大小;使用标准TA连接P5和P7接头(Adapter),可选用即用型或定制化的全长接头、短Y接头、特异性Index单标签、Index双标签等;根据接头或样本投入量,可选择是否需要PCR扩增,建库流程灵活;可结合多种杂交捕获探针组Panel,用于靶序列的富集。
IDT xGen DNA Lib Prep EZ 文库试剂盒将DNA片段切割、末端修复、末端添加A、接头连接、磁珠纯化全部纳入一个单管反应,将文库制备时间缩短为大约2小时,节省时间成本。其所需样本量低(1~250ng),偏倚低,可达到均一的序列覆盖。
IDT xGen DNA Lib Prep EZ 文库构建试剂盒适于多种应用,使用宏基因组样本进行试验时,各种投入量下的合成微生物群落表现一致。配合IDT接头、IDT探针组Panel,测序结果覆盖一致,且高度均一。
二、IDT xGEN cfDNA & FFPE DNA 文库制备试剂盒
用于降解严重的低质量DNA样本的文库构建,可在cfDNA循环游离DNA样本或从福尔马林固定或石蜡包埋(FFPE)组织提取的DNA样本中进行灵敏、准确的变异检测,可在≤1%的变异等位基因频率(VAF)下检测变异。采用特殊的连接法,相比传统TA连接法,转化率更高,并抑制接头二聚体形成。在连接接头时加入特异性分子标签(UMI)序列,用于去重和纠错。
建库步骤:
1、末端修复——使用末端修复混合酶将cfDNA或剪切过的DNA片段末端补平,以便连接;
2、连接1——使用新型连接酶将连接1接头加到DNA片段3'端,并防止DNA片段相互连接,减少嵌合体形成;连接1接头的3'端包含一个封闭基团,防止接头二聚体形成;
3、连接2——将与分子标签UMI互补的连接2接头作为引物,填补碱基间隙,连接到DNA片段的5'端,形成双链产物;
4、PCR——通过PCR加入Index、P5/P7序列等。
三、IDT xGen DNA 甲基化文库制备试剂盒
能高效地将重亚硫酸盐转化的单链DNA分子转化为用于表观遗传的研究文库,可用于基因组DNA、福尔马林固定或石蜡包埋FFPE样本提取DNA、cfDNA循环游离DNA、新鲜冷冻组织等,以进行全基因组甲基化测序(WGBS)、基于靶向杂交捕获的简化DNA甲基化测序(RRBS)、基于cfDNA的全基因组甲基化测序、经甲基化DNA免疫沉淀(MeDIP)或染色质免疫沉淀(ChIP)等方式富集的DNA测序等。文库分子复杂度更高、完整性更好、偏倚性更低。
采用先重亚硫酸盐转化、后制备文库的策略,尽可能将原始DNA分子转化为文库分子,相较于先建库后转化,IDT xGen DNA 甲基化文库试剂盒的分子复杂度有显著提升。IDT Adaptase技术,在接头连接时不受原始模板DNA序列影响,文库GC偏好性低,能准确还原基因组甲基化比例。实现更完整、偏倚度更低、更类似于WGBS的全面的甲基化基因组覆盖。
北京泽平代理的IDT NGS DNA 文库构建试剂盒
货号 |
反应数 |
文库制备试剂盒 |
特点 |
优势 |
10009863 |
16 |
xGen DNA EZ Library Prep Kit |
适用于酶切打断,并通过PCR加入标签的DNA建库方案。 |
样本兼容性好,适用于对实验结果要求高的IVD和LDT生产领域,文库产量高,高效快捷。 |
10009821 |
96 |
10009864 |
16 |
xGen DNA EZ Library Prep Kit UNI |
适用于酶切打断,并通过连接反应加入标签的DNA建库方案。 |
10009822 |
96 |
10009861 |
16 |
xGen DNA MC Library Prep Kit |
适用于机械打断,并通过PCR加入标签的DNA建库方案。 |
适合普通样本,高性价比。 |
10009819 |
96 |
10009862 |
16 |
xGen DNA MC Library Prep Kit UNI |
适用于机械打断,并通过连接反应加入标签的DNA建库方案。 |
10009820 |
96 |
10010206 |
16 |
xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep v2 MC Kit |
适用于机械打断,cfDNA或FFPE样本等低质量样本的DNA建库方案。 |
支持降解样本测低频突变,需要用UMI文库,高转化率和高复杂度。 |
10010207 |
96 |
10006202 |
16 |
xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit |
10006203 |
96 |
10009859 |
16 |
xGen ssDNA & Low-Input DNA Library Prep Kit |
能够从降解和损坏的单链DNA和双链DNA样本中制备文库。 |
针对降解程度最严重、单双链混合的样本,用于环境宏病毒、宏基因组、古DNA研究,超高的文库转化率。 |
10009817 |
96 |
10009860 |
16 |
xGen Methyl-Seq Library Prep Kit |
使用Adaptase末端连接技术在重亚硫酸氢盐转化后构建甲基化文库,用于表观遗传学研究。 |
先转化后建库,文库分子复杂度更高。 |
10009824 |
96 |
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——IDT一级代理商,北京泽平